前回はPlatanus1の結果だったけど、duploidのゲノムをアリルごとに区別してアセンブルしてくれるというPlatanus-alleleの結果を見てみると・・・
Platanus1の結果はどんなのだったかというと
Platanusはどちらもコンタミしている生物は無視してくるようだ。Platanus-alleleのほうがY軸のコンティグ長が若干長くなっていて、長く繋いでくれているみたい。Platanus-alleleの最終的なconsensusScaffold.faだけ見ると、バージョン1とそんなに変わらない印象だけど、Platanus-alleleのほうはduploidのアリルのヘテロ度が高い場合、別のscaffoldとして中間ファイルを出してくれるので、Platanus-alleleの論文にあるように、性決定遺伝子座とかを見たい場合により正確になっていそうな期待が持てる。