Illumina用アセンブラ比較 – Platanus-allele
前回はPlatanus1の結果だったけど、duploidのゲノムをアリルごとに区別してアセンブルしてくれるというPlatanus-alleleの結果を見てみると・・・ Platanus1の結果はどんなのだったかというと … 続きを読む
assembly
Illumina用アセンブラ比較
Illuminaのアセンブラとして、最近使っているのはCLC, SPAdes, platanus, MEGAHIT。velvetやSOAPdenovoはk-merのパラメータを振ってみないといけないけど、これらのツールは … 続きを読む