canu 1.9をDDBJスパコンのグリッドエンジンで動かす
canuのオプションでuseGrid=0としてグリッドエンジンを使わずに動かすのは簡単だけど、それだと時間がかかるので、グリッドエンジンを使って分散アセンブルをしたい場合。 スパコンで引っかかるのは、JAVAのメモリ指定 … 続きを読む
月: 2019年11月
2019年 水圏生物科学実験IIIレポート
2019年10月16日～11月1日の水・木曜日の9日間で、東京大学農学部 水圏生物科学専攻の学部3年生を対象にナノポアシーケンサーを用いた学生実習を行いました。 実習内容としては、三四郎池、不忍池から池の水を汲んできて、 … 続きを読む