ローカル版AlphaFoldを実行してdocker周りのエラーが出たら

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最新のdockerとかをCentOS7にインストールして、AlphaFoldを実行しようとしたら下記のようなエラーで止まってしまった。

Bad Request ("Unknown runtime specified nvidia")

どうやらPythonのdockerライブラリは古いnvidia toolkitを想定しているようで、最近のには対応していない？（参考：https://github.com/docker/docker-py/issues/2395 )

上記ページに対策が載っていたので、そのとおりにdocker/run_docker.pyを編集するとAlphaFoldを実行できた。

#      runtime='nvidia' if FLAGS.use_gpu else None,
      runtime=None,
      device_requests=[
        docker.types.DeviceRequest(count=-1, capabilities=[['gpu']])
      ],

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