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水圏生物工学研究室

東京大学大学院 農学生命科学研究科 水圏生物科学専攻

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月: 2023年4月

BioNano Access & Solveのインストール

2023年4月6日 by yoshitake

1年以上前にインストールしようとしたときはバグっぽい挙動で挫折した気がするけど、今度は比較的すんなり上手くいった。マッピング結果などを見るのがAccessで、マッピングやスキャッフォールディングを行うのがSolve。 B … 続きを読む

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バクテリア16S rRNAデータベースの比較検証

2023年4月13日2023年4月5日 by 溝端秀彬

M2の溝端です。今回は16S rRNAデータベースの検証をしました。 バクテリア16S rRNAデータベースは、メタゲノム解析においてblast検索に広く用いられる。 SILVAやGreengenesをはじめとして、多数 … 続きを読む

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