Linux (Ubuntu)の場合のインストール方法

まずは、パッケージマネジャを更新します。ターミナルで下記のコマンドを入力してください。

sudo apt update

実行したら、パスワードを聞かれるので、「programming」と入力します。入力しても何も表示されませんが、ちゃんと入力されていますので、「programming」と入力して「Enter」キーを押してください。更新したら下記のコマンドでBlastをインストールします。

sudo apt install -y ncbi-blast+

makeblastdb や blastn といったコマンドが使えるようになっているはずです。

下記のコマンドを入力します。

sudo apt install -y fastqc

ファイルダウンロード用のcurlコマンドをインストールしておきます。

sudo apt install -y curl

から

をダウンロード。ターミナルを開いて、下記のコマンドを実行。

cd ~/ダウンロード
sh MEGAN_Community_unix_6_20_8.sh

その後、「Next」などを押してインストールを進める。途中で下記の画面で使用するメモリの最大値を設定するところがあるので、6,000 MBに上げておく。デフォルトの2,000 MBでは不足する。

BLASTのインストール