ソースの表示以前のリビジョンバックリンク文書の先頭へ Share via Share via... Twitter LinkedIn Facebook Pinterest Telegram WhatsApp Yammer Reddit Teams最近の変更Send via e-Mail印刷パーマリンク × 目次 Linux 実際の例（スクリプトのメモ） R NGS解析ツール Deep Learning **文書の過去の版を表示しています。** Linux ファイルを縦に結合 ファイルを行でマージ ファイルのソート n行飛ばしてhead ファイル名一括置換 改行コードの変換 改行コードの変換/改行の削除 重複削除 中間ファイルを作らずにdiff/join等を実行 表を見やすく表示 四則演算 値の集計 読み込んだファイル1行ずつを対象にループを回す パスからファイル名を抜き出す awk/sed/grepの正規表現まとめ grid engineを用いてコマンドを分散処理する AWK：配列をソートした状態でforループ docker 実際の例（スクリプトのメモ） フォーマットが崩れたfastaファイルを整形 oboファイルからのGO関連の複数項目の抽出 mitofishのアノテーションファイルからCDS領域を抽出 CDS領域からfastaファイルを作成する BLAST結果のidからdbにマッチする行を再検索 R csHeatmap cummeRbundパッケージを用いて描いた図のラベル等を変更する cummeRbundを用いたexpressionPlotの色を後出しで編集する NGS解析ツール BLASTあれこれ fastaファイルをアミノ酸配列に変換 fastaファイルを任意の個数のファイルに分割 grid engineを用いて並列BLAST fastaファイルから欲しい配列のみ抜き出す gtfファイルに登録されたLocus情報からcDNAのfastaを作成 配列中の任意の文字の出現割合を集計 Deep Learning chainerの基本的な使い方 物体検出用ライブラリDetectronの使い方 kerasを使ったCNN tips.1531128640.txt.gz 最終更新: 2018/07/09 09:30by 133.11.222.89