ゲノムブラウザIGVの使い方

1. 解析サーバにログインします。
2. ターミナルを開いて、igv.shと入力。
3. メニューバーのGenomes→Load Genome From File…から、FASTAファイルをロードします。
4. マッピングデータの読み込みは、メニューバーのFile→Load From File…から、BAMファイルをロードします。 ほかにもGTFやVCFもIGVで読み込めます。

その他のTIPsは下記のページ参照。

http://bioinfo-dojo.net/2016/08/17/igv_mapping_data/