genestudio_megaなどをubuntuにインストール

RDP越しのLinuxのターミナルでのコピペ

LinuxのターミナルではCtrl+Shift+Cでコピー、Ctrl+Shift+Vで貼り付け。この場合、Windowsのクリップボードにもコピーされていて、WindowsのCtrl+C, Ctrl+Vと同期されている。 もう一つLinuxだけで有効なコピペは、単に文字列を選択するとコピーされていて、マウスの真ん中ボタンをクリックするとペーストされる。こっちのクリップボードはWindowsとは同期されない。

ターミナルを開く

画面左上のアクティビティをクリックし、「アプリケーションを表示する」をクリックし、「端末」を開く。(スクロールする必要があるかも)

英語のフォルダに変更

LANGUAGE=en xdg-user-dirs-update --force
cd ~; rm -rf ダウンロード テンプレート デスクトップ ドキュメント ビデオ ピクチャ ミュージック 公開 .mozilla

画面スリープ無効、DOCK位置変更

gsettings set org.gnome.desktop.session idle-delay 0
gsettings set org.gnome.shell.extensions.dash-to-dock intellihide-mode MAXIMIZED_WINDOWS
gsettings set org.gnome.shell.extensions.dash-to-dock dock-position BOTTOM
gsettings set org.gnome.shell.extensions.dash-to-dock extend-height false
gsettings set org.gnome.shell.extensions.dash-to-dock icon-size-fixed false
gsettings set org.gnome.shell.extensions.dash-to-dock dash-max-icon-size 24
gsettings set org.gnome.shell.extensions.dash-to-dock height-fraction 0.8

デスクトップアイコンの表示

sudo apt install -y gnome-tweak-tool
gnome-tweaks

Tweaksを起動し、「拡張機能」→「Desktop icons」と「Ubuntu dock」をON

cp /usr/share/applications/org.gnome.Terminal.desktop ~/Desktop
#デスクトップにできるアイコンを右クリックして「起動を許可する」をクリック

時計の位置変更

firefox https://extensions.gnome.org/extension/2/move-clock/
#「ここをクリックしてブラウザー拡張機能をインストールしてください」をクリックし、ページをリロード

Wine (Linux上でWindowsプログラムを実行するためのプログラム) インストール

sudo dpkg --add-architecture i386 
wget -nc https://dl.winehq.org/wine-builds/winehq.key
sudo apt-key add winehq.key
rm winehq.key
sudo add-apt-repository 'deb https://dl.winehq.org/wine-builds/ubuntu/ focal main'
sudo apt update
sudo apt install -y --install-recommends winehq-devel

GeneStudioインストール

firefox http://suikou.fs.a.u-tokyo.ac.jp:7080/sharing/MbwZT627H
#ダウンロード→ファイルを保存する→OK

wine ~/Downloads/GSProSetup.exe 
#適宜OKなどを選択して進める。User Nameは適当に。

echo '[Desktop Entry]
VERSION=1
Name=GeneStudio
Exec=wine /home/training/.wine/drive_c/Program\ Files\ \(x86\)/GeneStudio\,\ Inc/GStudio.exe
Type=Application' > ~/Desktop/org.gnome.GeneStudio.desktop
chmod 755 ~/Desktop/org.gnome.GeneStudio.desktop
#デスクトップにできるアイコンを右クリックして「起動を許可する」をクリック

デスクトップアイコンをダブルクリックして、実際にGeneStudioが起動するか確認する。

http://genestudio.com/

MEGAXのインストール

firefox http://suikou.fs.a.u-tokyo.ac.jp:7080/sharing/ncqxu37kU
#ダウンロード→ファイルを保存する→OK
sudo apt install -y ~/Downloads/megax_10.1.8-1_amd64.deb

echo '[Desktop Entry]
VERSION=1
Name=MEGAX
Exec=megax
Type=Application' > ~/Desktop/org.gnome.MEGAX.desktop
chmod 755 ~/Desktop/org.gnome.MEGAX.desktop
#デスクトップにできるアイコンを右クリックして「起動を許可する」をクリック

https://www.megasoftware.net/

MEGANのインストール

firefox http://suikou.fs.a.u-tokyo.ac.jp:7080/sharing/FmEAPwPxi
#ダウンロード→ファイルを保存する→OK
bash ~/Downloads/MEGAN_Community_unix_6_19_9.sh
#途中で「Create symlinks」のチェックは外す。
#Set max memory usage (in megabytes)は12,000 (=12GB)にする。

echo '[Desktop Entry]
VERSION=1
Name=MEGAN
Exec=/home/training/megan/MEGAN
Type=Application' > ~/Desktop/org.gnome.MEGAN.desktop
chmod 755 ~/Desktop/org.gnome.MEGAN.desktop
#デスクトップにできるアイコンを右クリックして「起動を許可する」をクリック

https://www.wsi.uni-tuebingen.de/lehrstuehle/algorithms-in-bioinformatics/software/megan6/

BLASTのインストール

SILVAデータベース

firefox http://suikou.fs.a.u-tokyo.ac.jp:7080/sharing/vV2baRL5f

https://www.arb-silva.de/no_cache/download/archive/release_138_1/Exports/

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  • 最終更新: 2020/09/18 06:04
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