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fastx_toolkitをインストールする際に、事前にlibgtextutilsをインストールすることになるが、そのビルド時に

error: cannot convert ‘std::istream’

とエラーが出るので古い言語を使用する指定をしてmakeする。

make CXXFLAGS='-std=c++03 -O1'

fastx_toolkit本体のコンパイル時にはlibgtextutilsのlib(lib/libgtextutils.a)とinclude(-I…include/gtextutils)パスを適切に指定された環境変数に入れる。