cummerbundを用いたexpressionplotの色を後出しで編集する

色の後出し変更

cummerbundはわかりやすく色を割り振ってくれるが、全部色を統一したい場合もある。

expressionPlot(zb.gene.cluster1_2,logMode = T,drawSummary = F)+ theme(legend.position = "none", axis.title = element_blank())

色付きだとグレースケールにしたとき見栄えが悪い。そこでscalecolormanual()を利用。今回は16遺伝子をプロットしたため、16本の線全てを黒色にした。

expressionPlot(zb.gene.cluster1_2,logMode = T,drawSummary = F)+ theme(legend.position = "none", axis.title = element_blank())+ scale_colour_manual(values = rep("black",16))

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  • 最終更新: 2018/02/24 02:55
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