csheatmap

csHeatmap(object,clustering="none/row/column/both",rescaling="none/row/column/both",...)

でヒートマップを描くことができる。なお、デフォルトのクラスタリングメソッドは特殊で負値に対応していないため、rescalingを適用するとエラーが出る。(z-scoreで規格化されるため)ノーマライズをかけたい場合は

csHeatmap(object,clustering = "row",rescaling ="row",method=dist,logMode = F,pseudocount = 1)

のように自分でメソッドを指定するとよい。

  • csheatmap.1509094682.txt.gz
  • 最終更新: 2017/10/27 08:58
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