**文書の過去の版を表示しています。**
通常フォーマットでのblastn
time blastn -db complete_partial_mitogenomes.fa -query 2021nanopore/mitofishsample.fasta -num_threads 1 -out 2021nanopore/mitofishsample.fasta.blastn
通常フォーマットでのvsearch
time vsearch --usearch_global mitofishsample.fasta --db complete_partial_mitogenomes.udb --id 0.9 --alnout mitofish090
通常フォーマットblastnをmeganに取り込む
vsearchでもmeganに取り込もうとしたが、なかなかうまくいかない。usearchについて調べたところ、usearch_grobalによる検索ではmeganに取り込めないらしい。
usearchlocalでのみ取り込めるが、vsearchにはusearchlocalに相当する機能がない。vsearchはmeganに利用不可か?