20211007

20211007

・Unifrac→Jaccard距離へ変更したい。出力ファイル名をinput.fq.tsv.result.unifrac → input.fq.tsv.result.jaccardに変更したいので対応

unifrac距離からjaccard距離に計算方法を変えるために吉武先生が作成してくれたスクリプトに対応できるように、いくつかのスクリプトを修正した。

PythonスクリプトとResult表示用のテンプレートファイルの.unifracを.jaccardに変更。

・属(genus)レベル、種(species)レベルでの集計結果を見てみたい。検索の出力ファイル名としては、「input.fq.tsv.genus.tsv.result.correlation」、「input.fq.tsv.species.tsv.result.correlation」などで作られ、個別のファイルが入ったDBフォルダ名は「dbgenus」、「dbspecies」とする予定。これらの検索結果もHTMLとして出力して欲しい

これらの結果を「result.html」、「result.species.html」、「result.genus.html」として分割したHTMLファイルとして出力。ここのファイルへのリンクをメールで送信する形とした。

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  • 最終更新: 2021/10/08 07:51
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