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20210729
ntデータベースにBLAST検索した時に魚類以外にヒットする問題に関して
- ntデータベースにBLAST検索をかけて作成したInputファイルの上位にオオカミ(Canis lupus),サンショウウオ(Desmognathus folkertsi),クロテン(Martes zibellina),ジャノメドリ(Eurypyga helias)が現れることが多々発生した。
- 可能性として、アダプタープライマーがシーケンスで読まれている可能性がある。
アダプタープライマー配列へのBLAST検索
MiFishの論文d3e799]にあるプライマーの配列