地図データの取得

スタートメニューからGeopapaOfflineFile.exeを起動。規約に同意すると起動する。
https://maps.gsi.go.jp/development/tileCoordCheck.html#9/35.9302/139.8930を元に欲しい地図の座標を選ぶ。{Zoomレベル}/{X座標}/{Y座標}で表示される。この情報を元にGeopapaOfflineTileの「ダウンロードする範囲」⇒「ズームレベル」、「座標」を選択する。
「ダウンロードする地図」で「地理院地図(標準地図)」を選択。（これ以外では上手くダウンロードされなかった。）
「ダウンロードズームレベル」を選択。（15を選択するとめちゃくちゃ時間がかかりそうだった。）
「Jpegに変換する」を選択。（これによりファイルサイズを1/3ほどに圧縮できる）
「保存する名前」を指定。（ここで指定した名前のフォルダが作成される）
「保存フォルダー」を指定。（ここで指定したフォルダに「保存する名前」で指定したフォルダが作成される。）
「mapurlファイルの設定」⇒特に何もしなかった。
「ダウンロード」をクリック
画像ファイルが指定したフォルダに作成されていく。

こちらのサイトhttps://sourceforge.net/projects/mobac/から、Mobile Atlas Createrをダウンロード。
ダウンロードしたZipファイルを解凍する。
Java Runtime Environment 1.8.0をインストール。（こちらのサイトhttps://adoptopenjdk.net/index.html?variant=openjdk11&jvmVariant=hotspotから、OpenJDK11をダウンロード⇒インストールした。）

解凍したMobile Atlas Creatorでstart.shを起動⇒Mobile Atlas Creatorが起動する。（Mobile Atlas Creator.exeから起動しようとするとエラーが発生する。）
OSMdroid Zip形式で新しいアトラスを作成。
「地図データの取得元」から地図データを選択。
「ズームレベル」でダウンロードしたいZoomレベルを選択
ドラッグして地図範囲を選択し、「選択範囲を地図に追加」をクリック。（この時「レイヤ名」を指定できる。）
「地図(アトラス)の構築処理の実行」で地図アトラスのダウンロードを行う。

多くの地図データで、リソースの一部が失われている OR 河川などがくっきり見えないという状態。

これら2課題を解決しているマップとして、「OpenStreetMap Public Transport」を選定。

MitoFish DBに属、科、種名があるのでそれをそのまま使えばよい

NCBIのDBはタクソノミーIDがでるので、それを変換してあげる必要はある。

Outfmt6にするとスペース以下が消えてしまう。 ⇒stitleのパラメータを付けておくと、最後まで表示される。

各生物が何リードずつあったかを数えていく。

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