基本的にはどのサーバでもインストール可能だが、/suikouの共有元であるm24ノードにログインして作業したほうが速いのでm24にログインする。
インストールの基本的な流れは次の通り(実際にはコンパイル途中でエラーが出でて進まないことが多いと思う)
cd /suikou/download
wget http://www.bcgsc.ca/platform/bioinfo/software/abyss/releases/2.0.2/abyss-2.0.2.tar.gz
tar zvxf abyss-2.0.2.tar.gz
cd /suikou/download/abyss-2.0.2
./configure --prefix=/suikou/tool/abyss-2.0.2 #prefixを指定して、特定のディレクトリ以下にバイナリをインストールさせる
make -j 4
make install
#ここからはパスを通すための設定
#ツールは/suikou/tool-all/binの中にシンボリックリンクを作成するとパスが通るようになっている。
#シンボリックリンクを作成する関数を定義してあるので、下記のコマンドを打てば/suikou/tool-all/binに/suikou/tool/abyss-2.0.2/binの中の実行ファイルのシンボリックリンクが作られる。
link1 /suikou/tool/abyss-2.0.2/bin
test