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研究室の解析サーバについて
次世代シーケンサーのデータ解析にはLinuxというWindowsでもMacでもないOSが使われます。研究室のLinuxサーバたちは購入時期がバラバラでスペックが異なるため、一番解析に影響するメモリー容量をもとにサーバの名前をつけています。(例:16GBのメモリーならm16)
また、どのサーバにログインしても基本的に使用できるコマンドは同じになるように設計されています。
ただし、いくつか例外があって、下記のサーバでしか動かないソフトがあります。下記のサーバは下記の用途で使用するため、他の目的では出来るだけ使用しないでください。
サーバ名 | |
m1536 | CLC Genomics Workbench |
m768c | CLC Genomics Workbench, Geneious |
m448, m256y, m64g, m48g | GPUを使うソフト |
m768 | Sequence ServerなどのWEBツール |
m32s | 共有ホームを提供しているサーバ、これが止まると全サーバが停止する |
m24 | グリッドエンジンのマスターサーバ |
またm512, m512bは調子が悪く、CPUを10コア以上長時間稼働させると再起動してしまうので注意。