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| parabricksの使い方 [2023/09/09 04:33] – suikou | parabricksの使い方 [Unknown date] (現在) – 削除 - 外部編集 (Unknown date) 127.0.0.1 | ||
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| - | 使い方としては、m1024にsshでログインして、 | ||
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| - | cd / | ||
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| - | とworkフォルダの本体のほうに移動してから、もしまだBWAのインデックスを作っていないなら | ||
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| - | ``` | ||
| - | bwa index ref.fasta | ||
| - | ``` | ||
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| - | としてインデックスを作って、下記のようにsingularity (現apptainer)を使ってGPUを使いながらマッピングが可能になります。 | ||
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| - | ``` | ||
| - | apptainer exec --nv --bind $PWD:$PWD --pwd $PWD / | ||
| - | ``` | ||