igvの使い方

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igvの使い方 [2021/04/19 16:27] 118.240.79.152igvの使い方 [Unknown date] (現在) – 削除 - 外部編集 (Unknown date) 127.0.0.1
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-# ゲノムブラウザIGVの使い方 
  
-1. 解析サーバにログインします。 
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-1. ターミナルを開いて、```igv.sh```と入力。 
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-1. メニューバーのGenomes->Load Genome From File...から、FASTAファイルをロードします。 
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-1. マッピングデータの読み込みは、メニューバーのFile->Load From File...から、BAMファイルをロードします。 
- ほかにもGTFやVCFもIGVで読み込めます。 
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-1. BAMを開いたら、Illuminaペアエンドデータなら、とりあえず右クリックして「View as pairs」をチェックしておくと良い。 
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-{{:pasted:20210420-012613.png}} 
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-その他のTIPsは下記のページ参照。 
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-[[http://bioinfo-dojo.net/2016/08/17/igv_mapping_data/]] 
  • igvの使い方.1618849622.txt.gz
  • 最終更新: 2021/04/19 16:27
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