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| 2024-魚種判別・系統解析 [2024/11/05 06:31] – yonezawa | 2024-魚種判別・系統解析 [2024/11/07 06:15] (現在) – yonezawa | ||
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| 行 5: | 行 5: | ||
| |ファイル名|注釈| | |ファイル名|注釈| | ||
| - | |1| | | + | |1|しらす（茨城産）F| |
| - | |2| | | + | |2|しらす（茨城産）R| |
| - | |3| | | + | |3|イワシ（銚子産）F |
| - | |4| | | + | |4|イワシ（銚子産）R |
| - | |5|| | + | |5|マダイ（三重産）F| |
| - | |6| | | + | |6|マダイ（三重産）R| |
| |7|サンマF| | |7|サンマF| | ||
| |8|サンマR| | |8|サンマR| | ||
| 行 29: | 行 29: | ||
| |23|パンガシウスF | | |23|パンガシウスF | | ||
| |24|パンガシウスR | | |24|パンガシウスR | | ||
| - | |25|マグロF | | + | |25|ビンチョウマグロF | |
| - | |26|マグロR | | + | |26|ビンチョウマグロR | |
| |27|イカF | | |27|イカF | | ||
| |28|タコF | | |28|タコF | | ||
| 行 42: | 行 42: | ||
| |36|タコ小判（おでん）R| | |36|タコ小判（おでん）R| | ||
| + | ## 製品の写真 | ||
| |1班| | |1班| | ||
| {{265490.jpg}} | {{265490.jpg}} | ||
| 行 49: | 行 50: | ||
| {{265485.jpg}} | {{265485.jpg}} | ||
| |4班| | |4班| | ||
| - | {{265484.jpg}} | + | {{:265484.jpg?400|}} |
| + | |||
| + | ## PCR結果 | ||
| + | |1班| | ||
| + | {{: | ||
| + | |2班| | ||
| + | {{: | ||
| + | |3班| | ||
| + | {{: | ||
| + | |4班| | ||
| + | {{: | ||
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| ## A. サンガーシーケンス配列解析、および系統樹作成のプログラムであるGeneiousの体験版をインストール | ## A. サンガーシーケンス配列解析、および系統樹作成のプログラムであるGeneiousの体験版をインストール | ||
| 行 229: | 行 242: | ||
| - NCBI NTデータベースとMitoFishデータベースの相同性検索結果に違いはあったか。どちらが望ましい結果だったか。 | - NCBI NTデータベースとMitoFishデータベースの相同性検索結果に違いはあったか。どちらが望ましい結果だったか。 | ||
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| - | - ネガティブコントロールは何が増えていたのか？ またネガティブコントロールと同じ結果になってしまったサンプルはどういうサンプルだったと言えるか？（実験のどの段階で怪しいと気づくことが可能だったか？） | ||
| - BLASTでヒットしたトップヒットの種や近縁種の配列をGenbankからダウンロードして系統樹に追加してみると期待したとおりになったか。 | - BLASTでヒットしたトップヒットの種や近縁種の配列をGenbankからダウンロードして系統樹に追加してみると期待したとおりになったか。 | ||