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| 2021_11_30 [2021/11/30 06:46] – 133.11.222.89 | 2021_11_30 [Unknown date] (現在) – 削除 - 外部編集 (Unknown date) 127.0.0.1 | ||
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| 行 1: | 行 1: | ||
| - | 通常フォーマットでのblastn | ||
| - | | ||
| - | time blastn -db complete_partial_mitogenomes.fa -query 2021nanopore/ | ||
| - | | ||
| - | 通常フォーマットでのvsearch | ||
| - | |||
| - | time vsearch --usearch_global mitofishsample.fasta --db complete_partial_mitogenomes.udb --id 0.9 --alnout mitofish090 | ||
| - | | ||
| - | 通常フォーマットblastnをmeganに取り込む | ||
| - | |||
| - | {{: | ||
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| - | vsearchでもmeganに取り込もうとしたが、なかなかうまくいかない。usearchについて調べたところ、usearch_grobalによる検索ではmeganに取り込めないらしい。 | ||
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| - | usearch_localでのみ取り込めるが、vsearchにはusearch_localに相当する機能がない。vsearchはmeganに利用不可か？ | ||
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