20211012

差分

このページの2つのバージョン間の差分を表示します。

この比較画面へのリンク

両方とも前のリビジョン 前のリビジョン
次のリビジョン		 前のリビジョン
20211012 [2021/10/12 07:37] – 133.11.144.1020211012 [Unknown date] (現在) – 削除 - 外部編集 (Unknown date) 127.0.0.1
行 1: 行 1:
-====== 20211012 ====== 
- 
-===== MetaSearch修正 ===== 
- 
-以下の修正 
- 
-①Kronaのグラフ作成のコードの冗長性を排除 
- 
- metasearch_exec.shの中でのKronaグラフの作成をfor文で回すことで冗長性を排除。 
- 
-②以下の要望を受けて修正 
- 
-''追加で要望なのですが、今は各サンプルでトップ10のものだけ表示にしてもらっていますが、多様性の高いサンプルだとこれでは半分以上がOthersでまとめられてしまうこともあるので、トップ100まで表示するように変更して頂けますでしょうか？'' 
- 
-こちらの仕様を追加するためにcreate_graph.pyを修正。 
- 
-===== 魚種組成の取得 ===== 
- 
-==== サーバでのデータの受け取り ==== 
- 
-req.bodyにデータが格納される。 
- 
-    let capturedSampleList = req.body['capturedSampleList[]'] 
- 
-==== 同期的にファイルを読み込む ==== 
- 
-同期的にファイルを読み込むには、fs.readFileSyncメソッドを使う。readFileだと非同期的にファイルを読み込むので、読み込み後に行いたい処理を先に行ってしまう。 
- 
-    capturedSampleList.forEach(sample => { 
-        sampleData = fs.readFileSync("inputFiles_with_japanesename/" + sample + ".mitodb.withJapaneseName.input", "utf-8"); 
-        sampleList = sampleData.split("\n"); 
-        for (let i = 1; i < sampleList.length; i++) { 
-            fishData = sampleList[i].split("\t"); 
-            if (fishData[0] in fish_comp) { 
-                fish_comp[fishData[0]] += parseInt(fishData[1]); 
-            } else { 
-                fish_comp[fishData[0]] = parseInt(fishData[1]); 
-            } 
-        }; 
-    }); 
- 
-これで魚種組成を取得できる。 
- 
-==== 参考にしたサイト ==== 
- 
-[[https://qiita.com/shirokuman/items/509b159bf4b8dd1c41ef]] 
- 
-[[https://qiita.com/am_/items/6a87a5dbf6d4ab328da3]] 
  
  • 20211012.1634024262.txt.gz
  • 最終更新: 2021/10/12 07:37
  • by 133.11.144.10