| 両方とも前のリビジョン 前のリビジョン 次のリビジョン | 前のリビジョン |
| nodejsウェブアプリケーション開発_2021 [2021/06/15 07:18] – [Day 10 (2021/6/16)] suikou | nodejsウェブアプリケーション開発_2021 [2021/06/17 02:27] (現在) – [最終課題] suikou |
|---|
| https://stackoverflow.com/questions/46482424/how-to-get-textual-stdout-from-console-logrequirechild-process-execsyncls | https://stackoverflow.com/questions/46482424/how-to-get-textual-stdout-from-console-logrequirechild-process-execsyncls |
| |
| 総合課題 | 課題 |
| | |
| | １．Expressの実行フォルダの中に適当なファイルを作り、そのファイル名をNodeJSのfsを使って表示する。 |
| | |
| | ２．上記ファイルをNodeJSのfsを使って消す。 |
| | |
| | |
| | ## 最終課題 |
| |
| 必須要件1：expressで動作するWEBアプリケーションを作成し、「http://localhost:3000/list/」にアクセスすると、サーバ上の特定のフォルダ(例：/opt/blast/dbとか、C:\opt\blast\dbとか）の中にある、ファイルの一覧を表示する。ファイルのリストの左横にはチェックボックス、ページ上部か下部に「削除」ボタンを表示し、「削除」ボタンを押すと、選択したチェックボックスのファイルを削除する。 | 必須要件1：expressで動作するWEBアプリケーションを作成し、「http://localhost:3000/list/」にアクセスすると、サーバ上の特定のフォルダ(例：/opt/blast/dbとか、C:\opt\blast\dbとか）の中にある、ファイルの一覧を表示する。ファイルのリストの左横にはチェックボックス、ページ上部か下部に「削除」ボタンを表示し、「削除」ボタンを押すと、選択したチェックボックスのファイルを削除する。 |
| |
| 必須要件2：「http://localhost:3000/upload/」にアクセスすると、FASTAファイルをアップロードして、BLASTDBを作成するページを作成する。例：http://suikou.fs.a.u-tokyo.ac.jp/upload_sequenceserver/ 。 | 必須要件2：「http://localhost:3000/upload/」にアクセスすると、FASTAファイルをアップロードして、BLASTDBを作成するページを作成する。例：http://suikou.fs.a.u-tokyo.ac.jp/upload_sequenceserver/ 。 |
| BLASTDBの作成は、FASTAが塩基配列であれば、「```makeblastdb -in input.fasta -dbtype nucl -hash_index -parse_seqids```」、FASTAがアミノ酸配列であれば、「```makeblastdb -in input.fasta -dbtype prot -hash_index -parse_seqids```」を使えばよい。ファイルのアップロードは次を参照。https://code-kitchen.dev/html/input-file/ | BLASTDBの作成は、FASTAが塩基配列であれば、「```C:\\Users\\xxx\\Downloads\\makeblastdb -in input.fasta -dbtype nucl -hash_index -parse_seqids```」、FASTAがアミノ酸配列であれば、「```/User/xxx/Download/makeblastdb -in input.fasta -dbtype prot -hash_index -parse_seqids```」を使えばよい。ファイルのアップロードは次を参照。https://code-kitchen.dev/html/input-file/ BLASTのダウンロードは「https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/」から。 |
| |
| 下記のオプションの内、2つ以上を実装すること。 | 下記のオプションの内、2つ以上を実装すること。 |
| |
| 5．BLASTDBファイルを削除するのか、リネームするのか選べるようにする。(リネーム機能には何が必要か考えて実装してみる。) | 5．BLASTDBファイルを削除するのか、リネームするのか選べるようにする。(リネーム機能には何が必要か考えて実装してみる。) |
| | |
| | 6．アップロードされるファイルの拡張子の種類を.fasta, .faと.fasta.gz, .fa.gzに限定し、.fasta.gz, .fa.gzの時はnodejsのzlibライブラリを使って解凍しておく。 |
| | |
| | 参考：https://webbibouroku.com/Blog/Article/html5-file-accept |
| | |
| | https://www.yoheim.net/blog.php?q=20141002 |
| |