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| nodejsウェブアプリケーション開発_2021 [2021/06/13 00:34] – [Day 9 (2021/6/14)] suikou | nodejsウェブアプリケーション開発_2021 [2021/06/17 02:27] (現在) – [最終課題] suikou |
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| 日本語： | 日本語： |
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| https://qiita.com/Yuuma-ujimoto/items/bc55ecddf4d0302b2992 | https://qiita.com/Yuuma-ujimoto/items/bc55ecddf4d0302b2992 |
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| | https://qiita.com/TakeshiNickOsanai/items/b1720dcbe2bb5f9e524f |
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| English： | English： |
| http://www.w3big.com/nodejs/nodejs-express-framework.html | http://www.w3big.com/nodejs/nodejs-express-framework.html |
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| | 課題 |
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| | １．フォームの値をGETメソッドで受け取れていることを、console.logで確認する |
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| | ２．受け取った値をindex.pugに渡して、ブラウザの画面上のどこかに表示する |
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| | ３．GETからPOSTに変更しても、クライアントからデータを正しく受け取って、ブラウザ画面上のどこかに表示する |
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| ## Day 10 (2021/6/16) | ## Day 10 (2021/6/16) |
| https://stackoverflow.com/questions/46482424/how-to-get-textual-stdout-from-console-logrequirechild-process-execsyncls | https://stackoverflow.com/questions/46482424/how-to-get-textual-stdout-from-console-logrequirechild-process-execsyncls |
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| | 課題 |
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| | １．Expressの実行フォルダの中に適当なファイルを作り、そのファイル名をNodeJSのfsを使って表示する。 |
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| | ２．上記ファイルをNodeJSのfsを使って消す。 |
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| | ## 最終課題 |
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| | 必須要件1：expressで動作するWEBアプリケーションを作成し、「http://localhost:3000/list/」にアクセスすると、サーバ上の特定のフォルダ(例：/opt/blast/dbとか、C:\opt\blast\dbとか）の中にある、ファイルの一覧を表示する。ファイルのリストの左横にはチェックボックス、ページ上部か下部に「削除」ボタンを表示し、「削除」ボタンを押すと、選択したチェックボックスのファイルを削除する。 |
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| | 必須要件2：「http://localhost:3000/upload/」にアクセスすると、FASTAファイルをアップロードして、BLASTDBを作成するページを作成する。例：http://suikou.fs.a.u-tokyo.ac.jp/upload_sequenceserver/ 。 |
| | BLASTDBの作成は、FASTAが塩基配列であれば、「```C:\\Users\\xxx\\Downloads\\makeblastdb -in input.fasta -dbtype nucl -hash_index -parse_seqids```」、FASTAがアミノ酸配列であれば、「```/User/xxx/Download/makeblastdb -in input.fasta -dbtype prot -hash_index -parse_seqids```」を使えばよい。ファイルのアップロードは次を参照。https://code-kitchen.dev/html/input-file/ BLASTのダウンロードは「https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/」から。 |
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| | 下記のオプションの内、2つ以上を実装すること。 |
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| | 1．表示するのをファイル一覧ではなく、BLAST DBのファイルのプレフィックス（nr.palとかだと、nrだけ）にして、選択されたDBのファイルたちを全部消す（nrが選ばれると、nr.pal, nr.pdb, nr.pos, nr.pot, nr.ptf, nr.ptoなどをまとめて消す)。 |
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| | 2．makeblastdbのコマンドがエラーになったときは、分かりやすいエラーメッセージを表示する。(例えば、FASTA以外のファイルが入力された時にmakeblastdbがエラー終了するときなど。) |
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| | 3．URLがhttp://localhost:3000/以外になっても対応できるように、またapacheなどのWEBサーバの下でnodejs-expressを動かすときのために、相対パスでpug, jsを記述する。 |
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| | 4．CSSを使って、見栄えを良くする。 |
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| | 5．BLASTDBファイルを削除するのか、リネームするのか選べるようにする。(リネーム機能には何が必要か考えて実装してみる。) |
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| | 6．アップロードされるファイルの拡張子の種類を.fasta, .faと.fasta.gz, .fa.gzに限定し、.fasta.gz, .fa.gzの時はnodejsのzlibライブラリを使って解凍しておく。 |
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| | 参考：https://webbibouroku.com/Blog/Article/html5-file-accept |
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| | https://www.yoheim.net/blog.php?q=20141002 |
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