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| 2020-魚種判別・系統解析 [2020/10/29 03:13] – [F. 提出物] suikou | 2020-魚種判別・系統解析 [2020/10/29 15:52] (現在) – suikou | ||
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| 行 153: | 行 153: | ||
| 13．Geneiousで「File」→「Import」→「From File...」をクリックし、先ほどダウンロードしたGenBankファイルを開く。 | 13．Geneiousで「File」→「Import」→「From File...」をクリックし、先ほどダウンロードしたGenBankファイルを開く。 | ||
| - | 14．シーケンスデータと、インポートしたGenBankファイルを選択し、「Align/ | + | 14．シーケンスデータと、インポートしたGenBankファイルを選択し、「Align/ |
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| 行 180: | 行 180: | ||
| 2．Geneiousの「File」→「Import」→「From File...」からダウンロードしたファイルを開く。その際、「Nucleotide sequences」→「Keep sequences separate」を選んでおく。 | 2．Geneiousの「File」→「Import」→「From File...」からダウンロードしたファイルを開く。その際、「Nucleotide sequences」→「Keep sequences separate」を選んでおく。 | ||
| - | 3．開いた配列を全て選択して、「Align/ | + | 3．開いた配列を全て選択して、「Align/ |
| 4．マルチプルアライメント結果を選択した状態で、「Tree」をクリックし、UPGMAによる系統樹を作成する。その際各分岐の確からしさをブートストラップ法によって求めるため、「Resample tree」にチェックを入れて「OK」を押す。 | 4．マルチプルアライメント結果を選択した状態で、「Tree」をクリックし、UPGMAによる系統樹を作成する。その際各分岐の確からしさをブートストラップ法によって求めるため、「Resample tree」にチェックを入れて「OK」を押す。 | ||