目次
rRNA配列を用いた魚種判別、系統樹解析
サンプルリスト
A. サンガーシーケンス配列解析、および系統樹作成のプログラムであるGeneiousの体験版をインストール
B. データベースで相同性検索を行う
C. 系統樹作成
D. 検討項目の例
rRNA配列を用いた魚種判別、系統樹解析
サンガーシーケンスのデータを開いて、データベースで相同性検索を行い、肉片の魚種を推定する。さらにシーケンスした配列を含めた魚類の系統樹を作成する。
サンプルリスト
ファイル名
注釈
1-Akauo
1-Ebi
1-Ika
1-Kurage
1-NC
ネガティブコントロール
1-Tako
2-Buri
2-Ika
2-NC
ネガティブコントロール
2-Sausage
2-Shirasu
3-Chi
3-Fish
3-NC
ネガティブコントロール
3-Nishi
3-Shisyamo-egg
3-Shisyamo-meat
3-Yama
4-Chikuwa
4-Kanikama
4-NC
ネガティブコントロール
4-Sasakama