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tvc [2017/07/21 01:22] – 作成 220.110.251.40tvc [Unknown date] (現在) – 削除 - 外部編集 (Unknown date) 127.0.0.1
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-# TVC torrent variant caller install 
  
-``` 
-mkdir tvc-build 
-wget updates.iontorrent.com/tvc_standalone/tvc-5.4.0.tar.gz 
- 
-wget http://updates.iontorrent.com/updates/software/external/armadillo-4.600.1.tar.gz 
-tar xvzf armadillo-4.600.1.tar.gz 
-cd armadillo-4.600.1/ 
-sed -i 's:^// #define ARMA_USE_LAPACK$:#define ARMA_USE_LAPACK:g' include/armadillo_bits/config.hpp 
-sed -i 's:^// #define ARMA_USE_BLAS$:#define ARMA_USE_BLAS:g'     include/armadillo_bits/config.hpp 
-cmake . 
-make -j4 
-cd .. 
- 
-wget updates.iontorrent.com/updates/software/external/bamtools-2.4.0.20150702+git15eadb925f.tar.gz 
-tar xvzf bamtools-2.4.0.20150702+git15eadb925f.tar.gz 
-mkdir bamtools-2.4.0.20150702+git15eadb925f-build 
-cd bamtools-2.4.0.20150702+git15eadb925f-build 
-cmake ../bamtools-2.4.0.20150702+git15eadb925f -DCMAKE_BUILD_TYPE:STRING=RelWithDebInfo 
-make -j4 
-cd .. 
- 
-tar xvzf tvc-5.4.0.tar.gz 
-cd tvc-build 
-cmake ../tvc-5.4.0 -DCMAKE_INSTALL_PREFIX:PATH=/suikou/tool/tvc-5.4.0 -DCMAKE_BUILD_TYPE:STRING=RelWithDebInfo 
-make -j8 
- 
-/suikou/tool/cmake-3.8.0/bin/cmake -E cmake_link_script CMakeFiles/tvc.dir/link.txt --verbose=1 #これを実行してコンパイル文を表示 
- 
-#c++のオプションの下記の部分を 
--lz -lpthread -lblas -llapack 
-#下記のように変更してコンパイル 
--lz -lpthread -llapack -lblas -lgfortran 
-make 
-make install 
- 
-``` 
  • tvc.1500600121.txt.gz
  • 最終更新: 2017/07/21 01:22
  • by 220.110.251.40