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- | ====== Linux ====== | ||
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- | [[ファイルを縦に結合]] | ||
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- | [[ファイルを行でマージ]] | ||
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- | [[ファイルのソート]] | ||
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- | [[n行飛ばしてhead]] | ||
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- | [[ファイル名一括置換]] | ||
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- | [[改行コードの変換]] | ||
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- | [[改行コードの変換/ | ||
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- | [[重複削除]] | ||
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- | [[中間ファイルを作らずにdiff/ | ||
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- | [[表を見やすく表示]] | ||
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- | [[四則演算]] | ||
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- | [[値の集計]] | ||
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- | [[読み込んだファイル1行ずつを対象にループを回す]] | ||
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- | [[パスからファイル名を抜き出す]] | ||
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- | [[awk/ | ||
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- | [[grid engineを用いてコマンドを分散処理する]] | ||
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- | [[AWK:配列をソートした状態でforループ]] | ||
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- | [[docker]] | ||
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- | [[docker内でインストールしたjupyter notebookへのアクセス方法]] | ||
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- | [[vimrc(木島のメモ)]] | ||
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- | [[多段sshとポートフォワーディングを用いてサーバ上のjupyter notebookにアクセスする]] | ||
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- | ====== 実際の例(スクリプトのメモ) ====== | ||
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- | [[フォーマットが崩れたfastaファイルを整形]] | ||
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- | [[oboファイルからのGO関連の複数項目の抽出]] | ||
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- | [[mitofishのアノテーションファイルからCDS領域を抽出]] | ||
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- | [[CDS領域からfastaファイルを作成する]] | ||
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- | [[BLAST結果のidからdbにマッチする行を再検索]] | ||
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- | [[WindowsのVirtual box上にCentOS7を導入しpython環境の構築]] | ||
- | ====== R ====== | ||
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- | [[csHeatmap]] | ||
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- | [[cummeRbundパッケージを用いて描いた図のラベル等を変更する]] | ||
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- | [[cummeRbundを用いたexpressionPlotの色を後出しで編集する]] | ||
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- | ====== Excel ====== | ||
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- | [[Excelで正規表現]] | ||
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- | ====== NGS解析ツール ====== | ||
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- | [[BLASTあれこれ]] | ||
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- | [[fastaファイルをアミノ酸配列に変換]] | ||
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- | [[fastaファイルを任意の個数のファイルに分割]] | ||
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- | [[grid engineを用いて並列BLAST]] | ||
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- | [[fastaファイルから欲しい配列のみ抜き出す]] | ||
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- | [[gtfファイルに登録されたLocus情報からcDNAのfastaを作成]] | ||
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- | [[配列中の任意の文字の出現割合を集計]] | ||
- | ====== Deep Learning ====== | ||
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- | [[chainerの基本的な使い方]] | ||
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- | [[物体検出用ライブラリDetectronの使い方]] | ||
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- | [[kerasを使ったCNN]] | ||
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- | [[NVIDIA DIGITS]] | ||
- | ====== 統合開発環境 ====== | ||
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- | [[Visual Studio Code上でのGitHubの連携]] | ||
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- | ====== Windows リモートデスクトップ ====== | ||
- | |||
- | [[該当サーバにRDPでほかの人が接続しているかどうかを調べる]] | ||
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- | ====== Windows Subsystem for Linux (WSL) ====== | ||
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- | [[Ubuntu 18.04インストール後の日本語化など]] | ||
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- | [[WSL再起動方法]] | ||