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tips [2018/07/27 07:56] – 133.11.222.89tips [Unknown date] (現在) – 削除 - 外部編集 (Unknown date) 127.0.0.1
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-====== Linux ====== 
- 
-[[ファイルを縦に結合]] 
- 
-[[ファイルを行でマージ]]  
- 
-[[ファイルのソート]] 
- 
-[[n行飛ばしてhead]] 
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-[[ファイル名一括置換]] 
- 
-[[改行コードの変換]] 
- 
-[[改行コードの変換/改行の削除]] 
- 
-[[重複削除]] 
- 
-[[中間ファイルを作らずにdiff/join等を実行]] 
- 
-[[表を見やすく表示]] 
- 
-[[四則演算]] 
- 
-[[値の集計]] 
- 
-[[読み込んだファイル1行ずつを対象にループを回す]] 
- 
-[[パスからファイル名を抜き出す]] 
- 
-[[awk/sed/grepの正規表現まとめ]] 
- 
-[[grid engineを用いてコマンドを分散処理する]] 
- 
-[[AWK：配列をソートした状態でforループ]] 
- 
-[[docker]] 
- 
-====== 実際の例（スクリプトのメモ） ====== 
- 
-[[フォーマットが崩れたfastaファイルを整形]] 
- 
-[[oboファイルからのGO関連の複数項目の抽出]] 
- 
-[[mitofishのアノテーションファイルからCDS領域を抽出]] 
- 
-[[CDS領域からfastaファイルを作成する]] 
- 
-[[BLAST結果のidからdbにマッチする行を再検索]] 
-====== R ====== 
- 
-[[csHeatmap]] 
- 
-[[cummeRbundパッケージを用いて描いた図のラベル等を変更する]] 
- 
-[[cummeRbundを用いたexpressionPlotの色を後出しで編集する]] 
-====== NGS解析ツール ====== 
- 
-[[BLASTあれこれ]] 
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-[[fastaファイルをアミノ酸配列に変換]] 
- 
-[[fastaファイルを任意の個数のファイルに分割]] 
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-[[grid engineを用いて並列BLAST]] 
- 
-[[fastaファイルから欲しい配列のみ抜き出す]] 
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-[[gtfファイルに登録されたLocus情報からcDNAのfastaを作成]] 
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-[[配列中の任意の文字の出現割合を集計]] 
-====== Deep Learning ====== 
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-[[chainerの基本的な使い方]] 
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-[[物体検出用ライブラリDetectronの使い方]] 
- 
-[[kerasを使ったCNN]] 
- 
-[[NVIDIA DIGITS]] 
-====== 統合開発環境 ====== 
- 
-[[Visual Studio Code上でのGitHubの連携]] 
  
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  • 最終更新: 2018/07/27 07:56
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