fastaファイルを任意の個数のファイルに分割

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fastaファイルを任意の個数のファイルに分割 [2017/10/20 06:40] – 作成 133.11.222.89fastaファイルを任意の個数のファイルに分割 [Unknown date] (現在) – 削除 - 外部編集 (Unknown date) 127.0.0.1
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-fastasplit 
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-%%-%%cオプションで分けるファイルの個数を指定。出力先ディレクトリも必須要項なので忘れないようにする。 
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-ex) ''%%fastasplit ../input.fa -c 300 .%%'' 
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-出力したファイルの行数を集計 
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-''%%for i in ./*;do grep ">" $i | wc -l;done | awk '{s += $1} END {print s}'%%'' 
  • fastaファイルを任意の個数のファイルに分割.1508481607.txt.gz
  • 最終更新: 2017/10/20 06:40
  • by 133.11.222.89