csheatmap

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csheatmap [2017/10/27 08:58] – 133.11.222.89csheatmap [Unknown date] (現在) – 削除 - 外部編集 (Unknown date) 127.0.0.1
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-cummeRbundを用いたHeatmapの描画 
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- 
-''%%csHeatmap(object,clustering="none/row/column/both",rescaling="none/row/column/both",...)%%'' 
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-でヒートマップを描くことができる。なお、デフォルトのクラスタリングメソッドは特殊で負値に対応していないため、rescalingを適用するとエラーが出る。(z-scoreで規格化されるため)ノーマライズをかけたい場合は 
- 
-''%%csHeatmap(object,clustering = "row",rescaling ="row",method=dist,logMode = F,pseudocount = 1)%%'' 
- 
-のように自分でメソッドを指定するとよい。 
- 
-詳しくは 
- 
-''%%?csHeatmap%%'' 
- 
-でヘルプを参照。 
  
  • csheatmap.1509094722.txt.gz
  • 最終更新: 2017/10/27 08:58
  • by 133.11.222.89