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--- 20220427_github_setting [2022/05/11 06:51] – 133.11.144.12
+++ 20220427_github_setting [Unknown date] (現在) – 削除 - 外部編集 (Unknown date) 127.0.0.1
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-====== Windows PC Local Environment Configuration from Github repository ======
-  download git and node.js
-<del>Unzip [[http://www.suikou.fs.a.u-tokyo.ac.jp/dokuwiki/doku.php?ns=%3A&image=%3Aid_ed25519.zip&do=media&tab_files=files&tab_details=view|The private key file]] and put it into C:\Users\//your user name//\ .ssh</del>
-Generating a new SSH key
-  ssh-keygen -t ed25519 -C "suikoucalender@gmail.com"
-Adding the SSH public key to the ssh-agent on GitHub suikou account setting page
-For the first time setting, clone the repository from github to your PC
-  git clone git@github.com:suikoucalender/mitosearch.git
-check if the website work functionally
-<del>npm install
-npm install ejs
-npm install i18n
-npm install –save express-session</del>
-  npm start
-  localhost:3004
-After changes occur, push
-  git add .
-  git commit -m "your message"
-   (when you do this step, it may ask "please tell me who you are", use this↓ first)
-    git config --global user.email "suikoucalender@gmail.com"
-    git config --global user.name "suikoucalender"
-  git push origin main
-Get the latest version remotely and merge to local
-  git pull
-====== Test enviroment ======
-port 3003
-Get the latest version remotely
-  git pull
-start program
-//Record the running logs, and monitor all file changes in the folder//
-  forever start -l forever.log -a -o out.log -e err.log --workingDir /home/yoshitake/mitosearch_dev/mitosearch/Mitosearch -c "npm start"  --watchDirectory ./ ./
- Stop program
-  forever list           # check the running forever program #
-  pwdx [pid]           # check the program's name #
-  forever stop[order or pid]           #stop the program #
-  lsof -i:3003           # Detect port-occupying processes #
-  kill [pid]           # kill port-occupying processes #
-//After running ```forever stop```, the reason why ```forever start``` does not run functionally is that even if the forever project is stopped, the port is still occupied, you can see the pid of the occupied project by using ```lsof -i:3003```, and after ```kill```ed it, ```forever start``` can go smoothly.//
-====== Production enviroment ======
-I move the old production environment to mitosearch.old(on m50v251n3.s)\\ Then cloned the repository from GitHub
-To update the database files on github
-  git add .
-  git commit -m "Database files updates"
-  git push origin main
-To update the production environment
-  git pull
-port 3004
-start program
-//Record the running logs, and monitor all file changes in the folder//
-  forever start -l forever.log -a -o out.log -e err.log --workingDir /home/yoshitake/mitosearch_dev/mitosearch/Mitosearch -c "npm start"  --watchDirectory ./ ./
- Stop program
-  forever list           # check the running forever program #
-  pwdx [pid]           # check the program's name #
-  forever stop[order or pid]           #stop the program #
-  lsof -i:3004           # Detect port-occupying processes #
-  kill [pid]           # kill port-occupying processes #
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-<del>2. また、既に実行されているMitoSearchDBを停止させておく。```forever list```で出てくるのはMetaSearchDBやMitoSearchがあるので、どれがMitoSearchDBかを調べるため、pidの数字に対して```pwdx <pid>```とpwdxを使って実行ディレクトリを調べて、```/home/yoshitake/mitosearch/mitosearch```で実行されているプロセスのuid前の数字(0,1,2,...程度の値)を割り出す。それから```forever stop <uid前の数字>```で停止できる。停止まで数分程度かかる様子。
-. 本番環境に移動する。''cd /home/yoshitake/mitosearch/''
-. リモートリポジトリ(/home/yoshitake/mitosearch\_repo)から、最新版をPull。''git pull'' (初回構築時は```git pull origin master```の必要あり)
-. もし新規に構築した場合、configファイル ''/home/yoshitake/mitosearch/Mitosearch/config/config.json'' とinputFileのシンボリックリンクの配置を''ln -s ~/mitosearch_db/db_fish/ ~/mitosearch/Mitosearch/db_fish''で行う。
-. ```git pull```が上手くできない場合(基本的にデプロイ後スクリプトの修正が入るとpullできない)、''git fetch origin master'' でリモートの最新の状態を取り込んだ後、''git reset \--hard origin/master'' でリセットをおこなう。
-※前回デプロイ時、Mitosearch/data/fish/lat-long-date.txtがローカル環境・本番環境両方から消失した。次回git pull時にはバックアップを取っておくよう注意！！！
-. アプリケーションのあるディレクトリに移動。''cd /home/yoshitake/mitosearch/mitosearch'' その後、依存関係を解消する。''npm install'' ''npm install i18n'' ''npm install --save express-session''
-. ```forever start --workingDir /home/yoshitake/mitosearch/mitosearch -c "npm start" ./``` で再起動。\\ ※startが上手くいかない時は取り敢えずPCをrebootした方が楽sudo reboot。foreverを再起動してもすぐ停止してしまうことがある（forever stopしてもポートが占有されている？）
-. これでデプロイ完了。</del>