20211012

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-====== 20211012 ====== 
- 
-===== MetaSearch修正 ===== 
- 
-以下の修正 
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-①Kronaのグラフ作成のコードの冗長性を排除 
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- metasearch_exec.shの中でのKronaグラフの作成をfor文で回すことで冗長性を排除。 
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-②以下の要望を受けて修正 
- 
-''追加で要望なのですが、今は各サンプルでトップ10のものだけ表示にしてもらっていますが、多様性の高いサンプルだとこれでは半分以上がOthersでまとめられてしまうこともあるので、トップ100まで表示するように変更して頂けますでしょうか？'' 
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-こちらの仕様を追加するためにcreate_graph.pyを修正。 
- 
-===== 魚種組成の取得 ===== 
- 
-==== サーバでのデータの受け取り ==== 
- 
-req.bodyにデータが格納される。 
- 
-    let capturedSampleList = req.body['capturedSampleList[]'] 
- 
-==== 同期的にファイルを読み込む ==== 
- 
-同期的にファイルを読み込むには、fs.readFileSyncメソッドを使う。readFileだと非同期的にファイルを読み込むので、読み込み後に行いたい処理を先に行ってしまう。 
- 
-    capturedSampleList.forEach(sample => { 
-        sampleData = fs.readFileSync("inputFiles_with_japanesename/" + sample + ".mitodb.withJapaneseName.input", "utf-8"); 
-        sampleList = sampleData.split("\n"); 
-        for (let i = 1; i < sampleList.length; i++) { 
-            fishData = sampleList[i].split("\t"); 
-            if (fishData[0] in fish_comp) { 
-                fish_comp[fishData[0]] += parseInt(fishData[1]); 
-            } else { 
-                fish_comp[fishData[0]] = parseInt(fishData[1]); 
-            } 
-        }; 
-    }); 
- 
-これで魚種組成を取得できる。 
- 
-==== 参考にしたサイト ==== 
- 
-[[https://qiita.com/shirokuman/items/509b159bf4b8dd1c41ef]] 
- 
-[[https://qiita.com/am_/items/6a87a5dbf6d4ab328da3]] 
- 
- 
-===== Tile Serverを起動して、タイルファイルのダウンロード ===== 
- 
-OpenStreetMapで地図の情報はPBFフォーマットという形式で保存されていて、それの一括ダウンロードは可能。 
-[[https://download.geofabrik.de/]] 
- 
-そして、PBFから画像を取得するには、どうやらspecial softwareが必要みたいで、幾つか選択肢が書かれている。 
-[[https://www.geofabrik.de/data/download.html]] 
- 
-一番今の実装に近いのは、Tile serversを構築することかなと思いました。具体的には下記のdockerを使えば、簡単にセットアップできそうな感じはしました。\\ 
-[[https://switch2osm.org/serving-tiles/using-a-docker-container/]] 
- 
-上記ページに、 
-http://your.server.ip.address/tile/0/0/0.png 
-で地図が取れるよ、と書いていて、今の伊藤くんがajaxで取得しているパスと一緒なのではないでしょうか？ 
- 
-==== 地図データのダウンロード ==== 
- 
-    wget https://download.geofabrik.de/africa/zambia-latest.osm.pbf 
  
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  • 最終更新: 2021/10/12 09:02
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