20210506

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-====== 20210506 ====== 
  
-===== グラフを描画するためのモジュールを作成 ===== 
-createGraphモジュールでグラフを表示するHTMLファイルを生成 
- 
-tmp/Hash値/Hash値/graphs\_cor.html と tmp/Hash値/Hash値/graphs\_unifrac.htmlが生成される 
- 
-これをresult.htmlでiframeタグを利用して表示する。 
- 
- 
-==== 凡例の文字サイズの変更 ==== 
-  var options = { legend: { textStyle: { fontSize: 8 } } }; 
- 
-==== 条件に一致するファイルやディレクトリの一覧を取得する ==== 
-[[https://www.javadrive.jp/python/file/index14.html]] を参照 
-globモジュールを利用 
- 
-  import glob 
-  for name in glob.glob('./test/b*'): 
-    print(name) 
- 
-以下の出力が得られる 
- 
-  >> ./test\back 
-  >> ./test\book.png 
-  >> ./test\book.txt 
- 
-==== リストの結合 ==== 
- 
-  list + list 
-もしくは 
-  list.extend(list) 
- 
-==== get()メソッドを使ってキーが存在しない場合はデフォルト値を取得 ==== 
-  * 辞書オブジェクトのget()メソッドを使うと、キーが存在しない場合にエラーを発生させずに任意の値(デフォルト値)を取得できる 
-  * 第一引数にキーを指定する。キーが存在する場合は対応する値valueが返り、キーが存在しない場合はNoneが返る。 
-  * None以外の値を返したい場合は、第二引数にキーが存在しない場合に返すデフォルト値を指定する。 
- 
-===== KronaのSingularityコンテナの作成 ===== 
- 
-  - 学生実験用Linuxにssh接続 
-  - KronaイメージをPull 【[[https://hub.docker.com/r/biocontainers/krona]]】コマンドは''docker pull biocontainers/krona:v2.7.1_cv1'' 
-  - SingularityイメージをBuild。コマンドはsudo singularity build krona_v2.7.1_cv1.sif docker-daemon://biocontainers/krona:v2.7.1_cv1 
-   
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  • 最終更新: 2021/05/06 07:41
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