20210303

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-====== 全体概要図 ====== 
-{{:img_0140.jpg?direct&600|}} 
-{{:img_0142.jpg?direct&600|}} 
-{{:img_0143.jpg?direct&600|}} 
-===== メールアドレスをサーバに送信 ===== 
-  - FileReaderが非同期的にファイルを読み込むため、[[http://gakki-uec15.hatenablog.com/entry/2019/09/19/234833]]を参考に、ファイル読み込みを同期的に行うようにした。 
-  - email入力欄を作成、入力した項目はサーバに送信 
  
-index.pug 
- 
-  .container 
-    h1 #{title} 
-    p this is #{title} 
-    p Upload your fasta file below 
-    form(action="./upload" method="POST" enctype="multipart/form-data") 
-      input(type="file" name="file" id="inputfile") 
-      input(type="text" id="email") 
-      button(type="button" onclick="file_upload()" value="Upload") 
-    script. 
-        var slice_size = 100 * 1024 * 1024; 
-        var files; 
-        var file; 
-        var slice_file; 
-        var reader = new FileReader(); 
-        var content; 
-        var sendData = {}; 
-        function file_upload() { 
-            var slice_file = $("#inputfile")[0].files[0].slice(0,slice_size); 
-            reader.readAsText(slice_file); 
-            reader.onload = function() { 
-                content = reader.result; 
-                console.log(content); 
-                sendData.fileContent = content; 
-                sendData.email = $("#email")[0].value; 
-                $.ajax({ 
-                    type: "POST", 
-                    url: "./upload/", 
-                    data: sendData, 
-                    dataType: "json", 
-                }) 
-                .done(function(res){ 
-                    console.log("success"); 
-                }) 
-                .fail(function(res){ 
-                    console.log("falied"); 
-                }); 
-            } 
-        } 
- 
-===== NCBI SRAのサイトからサンプルや実験手法が分かるデータを抽出 ===== 
-Submitted by 
-  curl https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/?term=ERR000500   |grep "Submitted by" |awk '{print substr($0, index($0, "Submitted by:"))}'|awk '{print substr($0, 1, index($0, "</span>")-1)}' | sed -e 's/Submitted by: <span>//' 
- 
-Study 
-  curl https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/?term=DRR000002   |grep "Study" |awk '{print substr($0, index($0, "Study:"))}'|awk '{print substr($0, 1, index($0, "<div")-1)}' | sed -e 's/Study: <span>//' 
- 
-Sample 
-  curl https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/?term=DRR000089  |grep "Sample" |awk '{print substr($0, index($0, "Sample:"))}' |awk '{print substr($0, 1, index($0, "<div")-1)}'| sed -e 's/Sample: <span>//' 
-   
-   
-やること 
-  * メールアドレスの余分な文字列を消す 
-  * SRAのリンクを取得 
-  * Node.js 側でもファイル名、、メールアドレスのチェックを行う 
  • 20210303.1614759157.txt.gz
  • 最終更新: 2021/03/03 08:12
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