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スパコン利用方法 [2017/05/30 09:10] – 133.11.222.89 | スパコン利用方法 [Unknown date] (現在) – 削除 - 外部編集 (Unknown date) 127.0.0.1 | ||
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- | # スパコン利用方法 | ||
- | m24などの適当なサーバにログインする | ||
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- | su - suikou | ||
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- | (pass: suikou) | ||
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- | ssh -l kyoshita slogin.hgc.jp | ||
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- | これで東大医科研のスパコンにログイン出来る。 | ||
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- | ログインしたら、まずは | ||
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- | qlogin | ||
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- | を入力して、 | ||
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- | それから解析したいコマンドが例えば手元のPCで行う場合に、 | ||
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- | blastn -db nt -query test.fasta -outfmt 6 -num_threads 4 | ||
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- | とかの場合、スパコンでは | ||
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- | qsub ~/qsubsh4 " | ||
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- | とするとグリッドエンジンにジョブを投げてくれます。 | ||
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- | # ファイルの転送方法 | ||
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- | suikou ユーザで解析サーバにログインして、 | ||
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- | scp file.fastq kyoshita@slogin.hgc.jp: | ||
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- | ディレクトリごと転送する場合は | ||
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- | scp -r dir kyoshita@slogin.hgc.jp: | ||
- | |||
- | とすればよい。 |