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--- サーバ新規追加時の手順 [2020/01/29 05:04] – 133.11.222.89
+++ サーバ新規追加時の手順 [Unknown date] (現在) – 削除 - 外部編集 (Unknown date) 127.0.0.1
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-# サーバ新規追加時の手順
-## CentOS7 DVDからsetup
-日本語を選択 (```LANG=ja_JP.UTF-8```にするためで、英語にすると、```LANG=en_US.UTF-8```となり、sortなどのプログラムの挙動が変わってしまうので日本語に揃える）
-ソフトウェアの選択→GNOME Desktop
-パーティションの設定→手動にして、/を大きくとるように設定
-KDUMP無効
-ネットワーク→ONにして設定の全般で自動的に接続するにチェック→ホスト名をm384などとつける
-ネットワークのIPアドレスを下記のように固定で設定する。
-```
-方式：手動
-アドレス（追加）
-アドレス：（例）192.168.251.120
-ネットマスク：24
-ゲートウェイ：192.168.251.1
-DNSサーバ：192.168.251.201
-ドメインを検索：s
-```
-rootパスワード:suikou
-最初のユーザとして、とりあえずyoshitakeなどと作っておき、管理者権限を付与する。
-[[サーバのipアドレスとホスト名の対応表]]にサーバの名前を追加しておくこと。
-## DNS登録
-サーバの名前でアクセスできるようにするために、[[内部dns登録]]のページに従って登録する。
-## セットアップ後にまずやること
-アカウント：セットアップ時に登録した管理者ユーザ(例：yoshitake)でログインする。
-### 最初に管理者userをID指定して作成
-```
-sudo su
-```
-```
-uid=600
-id=suikou
-pass=suikou
-groupadd -g $uid $id
-sudo useradd -u $uid -g $id -d /home/$id -s /bin/bash $id
-echo -e "$pass\n$pass"|passwd $id
-gpasswd -a $id wheel
-sed -i 's/^%wheel\tALL=(ALL)\tALL/%wheel\tALL=(ALL)\tNOPASSWD: ALL/' /etc/sudoers
-```
-## 設定ファイルコピー
-```
-#echo "search s" >> /etc/resolv.conf -> OSインストール時に設定 もしくは nmtuiで
-#scp m24.s:/etc/hosts /etc/hosts
-#sudo yum -y install nfs-utils #まだNFSをインストールしていない場合
-mkdir /suikou
-mkdir /suikou/tool /suikou/tool-all /suikou/db /suikou/download /suikou/files
-echo '
-m12.s:/home          /home            nfs exec,dev,suid,rw,bg,hard,intr
-m12.s:/home/tool     /suikou/tool     nfs exec,dev,suid,rw,bg,hard,intr
-m12.s:/home/tool-all /suikou/tool-all nfs exec,dev,suid,rw,bg,hard,intr
-m24.s:/suikou/root     /root            nfs exec,dev,suid,rw,bg,hard,intr
-m24.s:/suikou/db       /suikou/db       nfs exec,dev,suid,rw,bg,hard,intr
-m24.s:/suikou/download /suikou/download nfs exec,dev,suid,rw,bg,hard,intr
-' >> /etc/fstab
-mount -a
-```
-## SE Linux無効化設定
-```
-setenforce 0
-sed -i 's/SELINUX=enforcing/SELINUX=disabled/' /etc/selinux/config
-```
-## Firewall無効化設定
-```
-systemctl stop firewalld.service
-systemctl disable firewalld.service
-```
-## zabbixインストール
-```
-#rpm -ivh http://repo.zabbix.com/zabbix/3.2/rhel/7/x86_64/zabbix-agent-3.2.4-2.el7.x86_64.rpm
-rpm -ivh /suikou/download/zabbix-agent-3.2.4-2.el7.x86_64.rpm
-sed -i 's/Server=127.0.0.1/Server=192.168.251.202/; s/ServerActive=127.0.0.1/ServerActive=192.168.251.202/' /etc/zabbix/zabbix_agentd.conf
-#sudo yum install sysstat #もしもiostatがインストールされていない場合
-echo "
-Timeout=30
-UserParameter=hdd.rmbyte[*],iostat -mdx 1 2 | grep \$1 | awk '{print \$\$6}'|tail -n 1
-UserParameter=hdd.wmbyte[*],iostat -mdx 1 2 | grep \$1 | awk '{print \$\$7}'|tail -n 1
-UserParameter=toppro,top -b -n 1 | sed -e \"1,6d\" | head -6|awk '{print \$2\" \"\$9\" \"\$10\" \"\$12}'
-" >> /etc/zabbix/zabbix_agentd.conf
-systemctl start zabbix-agent
-systemctl enable zabbix-agent
-```
-### zabbixサーバから確認(おまけ)
-```
-ssh suikouvm.s
-zabbix_get -s (インストール中のサーバのIPアドレス) -k agent.version
-```
-### zabbix管理ページへの登録
-http://suikouvm.s/zabbix にアクセスし、(Adminでログイン(pw: suikou))
-設定→ホスト→ホストの作成　をクリックし、
-新規サーバの
-- ホスト名
-- グループ(Linux serversを選択し、左矢印をクリック)
-- エージェントのインターフェイス　IPアドレス
-を設定する。まだ「追加」はクリックせずに、「テンプレート」タブを開き、「新規テンプレートをリンク」のところで、
-. 選択をクリックし、「Template OS Linux」を選択する。
-. 真ん中の追加をクリック
-. 一番下の追加をクリック
-{{2017-05-11.png}}
-それから、監視データ→スクリーン→スクリーンの変更ページを開いて、適宜グラフ、シンプルグラフを追加する。
-## gcc install等
-```
-#yum -y groupinstall "GNOME Desktop" #minimumでインストールした場合
-yum -y groupinstall "Development Tools" #--setopt=group_package_types=mandatory,default,optional をつける必要があるかも
-yum -y install libX11-devel libXt-devel libXext-devel
-yum -y install epel-release
-yum install -y libunwind libicu libgdiplus
-yum install -y squashfs-tools #for singularity
-```
-## 外付けUSBマウント関係
-```
-yum -y install ntfs-3g
-yum -y localinstall /suikou/download/exfat-utils-1.2.7-1.el6.x86_64.rpm
-yum -y localinstall /suikou/download/fuse-exfat-1.2.7-1.el6.x86_64.rpm
-```
-## NFS設定
-```
-#sudo yum -y install nfs-utils #まだNFSをインストールしていない場合
-mkdir /data
-echo '/data 192.168.0.0/16(rw,insecure,no_subtree_check,async,no_root_squash)' >> /etc/exports
-exportfs -ra
-sudo systemctl restart rpcbind
-sudo systemctl restart nfs-server
-sudo systemctl enable rpcbind nfs-server
-```
-## サーバのフォルダを他からも見えるように登録の準備
-nano /root/auto.suikou.files
-他のサーバの記述を参考に、新規サーバを追加
-## XRDPインストール
-```
-yum -y install xrdp
-systemctl start xrdp
-systemctl enable xrdp
-yum -y groupinstall xfce
-sed -i 's/max_bpp=32/max_bpp=24/' /etc/xrdp/xrdp.ini
-```
-## RStudio Serverインストール
-```
-yum -y install httpd
-yum -y localinstall /suikou/download/rstudio-server-rhel-1.1.383-x86_64.rpm
-echo "rsession-which-r=/suikou/tool/R-3.4.2/bin/R" >> /etc/rstudio/rserver.conf
-echo "ProxyPass /rstudio/ http://localhost:8787/
-ProxyPassReverse /rstudio/ http://localhost:8787/
-RedirectMatch permanent ^/rstudio$ /rstudio/" >> /etc/httpd/conf/httpd.conf
-systemctl start httpd
-systemctl enable httpd
-systemctl enable rstudio-server.service
-sed -i 's%[[]Service]$%[Service]\nEnvironment="LD_LIBRARY_PATH=/suikou/tool-all/lib64:/suikou/tool-all/lib"\nEnvironment="PATH=/suikou/tool/miniconda2/bin:/suikou/tool-all/bin:/usr/local/bin:/usr/bin:/bin:/usr/local/sbin:/usr/sbin"\nEnvironment="LDFLAGS=-L/suikou/tool-all/lib"\nEnvironment="CFLAGS=-I/suikou/tool-all/include"\nEnvironment="CXXFLAGS=-I/suikou/tool-all/include"\nEnvironment="CPPFLAGS=-I/suikou/tool-all/include"\nEnvironment="PKG_CONFIG_PATH=/suikou/tool-all/lib/pkgconfig"%' /etc/systemd/system/rstudio-server.service
-systemctl start rstudio-server.service
-```
-## autofs設定
-```
-#sudo yum -y install autofs #まだautofsをインストールしていない場合
-sed -i 's/^+auto.master$/#+auto.master/' /etc/auto.master
-echo "/suikou/files   /etc/auto.suikou.files   --timeout=0" >> /etc/auto.master
-scp m24.s:/root/auto.suikou.files /etc/auto.suikou.files
-sudo systemctl start autofs
-sudo systemctl enable autofs
-```
-## ラボメンバー全員のアカウント登録
-```
-cd /root
-./run-setup-user-linux.sh
-```
-## Grid Engine 参加設定
-```
-ssh m24.s
-```
-```
-source /suikou/tool/bashrc.sh
-nano /etc/hosts #新しいサーバのアドレスと名前を書く必要あり
-qconf -as (新しいサーバの名前)
-qconf -ah (新しいサーバの名前)
-exit
-```
-```
-cd /suikou/tool/ge6.2u6
-hostip=`ip addr|grep 192.168.251|sed 's/.*inet //; s/\/.*//'`
-hostnm=`hostname`
-echo "192.168.251.101 m24
-$hostip $hostnm" >> /etc/hosts
-./install_execd
-質問はすべてEnterで良い
-```
-```
-source /suikou/tool/ge6.2u6/default/common/settings.sh
-qconf -rattr exechost complex_values mem_req=`free -g|grep "^Mem:"|awk '{print $2}'`G `hostname`
-```
-## ファイルオープン数上限緩和
-```
-echo '* soft nofile 65536
-* hard nofile 65536' >> /etc/security/limits.conf
-```
-## 共有フォルダ周りの設定
-suikouvmにログインして、下記の設定を行う。ただし共有フォルダの接続をリセットしてしまうため、共有フォルダ利用者がいないか、zabbix等で確認すること。
-```
-ssh -l root suikouvm.s #password: suikou
-scp m24.s:/root/auto.suikou.files /etc/auto.suikou.files
-systemctl restart autofs
-ls /home/user1/files/
-#samba共有へ追加(例としてm64gを追加する場合)
-ln -s /suikou/files/m64g /samba/share
-exit
-```
-解析ノード全体で/dataフォルダを共有するため、下記のコマンドを実行する。共有フォルダの接続をリセットしてしまうため、ほかのユーザがサーバを使用していないか確認すること。(下記のコマンドはrootユーザではなく、suikouユーザなど管理者権限のある管理者ユーザを使用すること。sshの公開鍵を登録していれば、どの解析サーバで下記コマンドを実行しても良いが、不明な場合はm768.sから実行するのが良い。)
-```
-for i in `qhost|tail -n+4|cut -f 1 -d " "`; do echo $i; ssh $i sudo /root/run-setup-add-nfs.sh; done
-```
-suikougwの、/suikou/files以下のNFSの設定変更もやっておく。
-```
-ssh suikougw #suikougwはrootでのsshログインを不可にしてあるので、一般ユーザでログインすること
-su - #パスワードはsuikou
-scp m24.s:/root/auto.suikou.files /etc/auto.suikou.files
-systemctl restart autofs
-```
-## サーバスペックを更新
-[[サーバスペック]]
-## サーバのipアドレスとホスト名の対応表を更新
-[[サーバのipアドレスとホスト名の対応表]]
-## メンバー追加時の手順を実行する
-[[メンバー追加時の手順]]ページのサーバ名を追加して、実行する。
-## 簡略化インストール
-```
-sudo su
-```
-```
-scp m24.s:/root/run-setup-package.sh .
-bash run-setup-package.sh
-```
-### 共有フォルダ
-```
-#sudo yum -y install autofs #まだautofsをインストールしていない場合
-sed -i 's/^+auto.master$/#+auto.master/' /etc/auto.master
-echo "/suikou/files   /etc/auto.suikou.files   --timeout=0" >> /etc/auto.master
-nano /root/auto.suikou.files #新規サーバを共有する場合は編集する
-cp /root/auto.suikou.files /etc/auto.suikou.files
-sudo systemctl start autofs
-sudo systemctl enable autofs
-cd /root
-./run-setup-user-linux.sh #ユーザ追加と各ユーザの共有フォルダのシンボリックリンクを作成する
-su - suikou
-ssh m768
-source /suikou/tool/ge6.2u6/default/common/settings.sh
-for i in `qhost|tail -n+4|cut -f 1 -d " "`; do echo $i; ssh $i sudo cp /root/auto.suikou.files /etc/auto.suikou.files; ssh $i sudo systemctl restart autofs; done
-ssh -l root suikouvm.s #password: suikou
-cp /root/auto.suikou.files /etc/auto.suikou.files
-systemctl restart autofs
-ls /home/user1/files/
-#samba共有へ追加(例としてm64gを追加する場合)
-ln -s /suikou/files/m64g /samba/share
-exit
-```
-### Grid Engine 参加設定
-```
-ssh m24.s
-```
-```
-source /suikou/tool/bashrc.sh
-nano /etc/hosts #新しいサーバのアドレスと名前を書く必要あり
-qconf -as (新しいサーバの名前)
-qconf -ah (新しいサーバの名前)
-exit
-scp m24.s:/etc/hosts /etc/hosts
-```
-```
-cd /suikou/tool/ge6.2u6
-./install_execd
-質問はすべてEnterで良い
-source /suikou/tool/ge6.2u6/default/common/settings.sh
-qconf -rattr exechost complex_values mem_req=`free -g|grep "^Mem:"|awk '{print $2}'`G `hostname`
-```